Sim e não.
O uso do TOR impedirá que seu ISP veja exatamente o que você está fazendo.
Seu ISP, no entanto, será capaz de ver que você está usando o TOR com base nos "nós de saída" vistos no pacote - eles poderiam bloqueá-lo com base neles.
Eles também poderão ver o tamanho dos pacotes e a frequência dos pacotes, e poderão fazer algumas inferências sobre o tipo de coisa que você está fazendo - embora não exatamente o que você está fazendo!