Correto. Cada dispositivo individual só recebe / transmite a 100Mb, mas o tráfego entre os dois switches pode utilizar a velocidade total de gigabit.
Isso só se aplicaria se vários dispositivos estivessem transmitindo simultaneamente através do link entre os switches, no entanto. Na prática, duvido que você notasse muita diferença, a menos que seus dispositivos estejam transmitindo perto da capacidade regularmente.