"I have ticked the boxes in settings > preferences > MISC > enable and update silently but the reload message box still didn't show up."
Se você assinalou a caixa "Atualizar silenciosamente", ela está configurada para ser atualizada silenciosamente - o que significa que nenhuma caixa de aviso será mostrada na atualização.
UN marque "Atualizar silenciosamente" e a caixa deve começar a aparecer novamente.