Parece que os softwares que você mencionou são instalados via pacotes de snap. Você pode verificar a lista de snaps instalados executando
snap list
Você pode iniciar individualmente um software de encaixe instalado executando
snap run <package-name>
(substitua <package-name>
por um nome encontrado na saída de snap list
).
Para encontrar o software em "Atividades" ou "Mostrar Aplicativos", você terá que criar um arquivo .desktop
personalizado. Veja este Q & A para referência: o pacote snap okular não aparece nos aplicativos e o comando 'okular' não é reconhecido