Funcionalmente, não há motivo para isso não funcionar - se funciona internamente, deve funcionar externamente.
De um ponto de vista prático - proteja a unidade! Estático, poeira, água, calor variável, impacto, a lista de potenciais armadilhas é enorme. Alguns desses riscos (poeira, impacto) estão presentes interna e externamente - mas o risco e o impacto de tais eventos são muito ampliados quando não há um imenso PC envolvendo a unidade.
Pessoalmente, se a velocidade é crítica e tempo é dinheiro, recomendo que você adquira uma placa USB3 para o seu PC e use uma unidade - ou examine a possibilidade de uma base SATA na qual a unidade se encaixa e depois garanta que você coloque o berço da unidade em algum lugar seguro e geralmente fora do alcance (prateleira com cabos atrás dele, atrás do PC, etc.).
Espero que isso proteja