Se não estou enganado, você pode desativá-lo nas configurações do sistema e ele ficará off-line?
Se isso não funcionar, você pode desativar o serviço em si.
sudo systemctl disable bluetooth.service && sudo systemctl stop bluetooth.service
Se você quiser ativá-lo novamente.
sudo systemctl enable bluetooth.service && sudo systemctl start bluetooth.service
O ativar e desativar é usado para que durante a próxima inicialização seja iniciado ou não.