Os gráficos vetoriais são independentes da resolução. Basicamente, eles são uma série de coordenadas matemáticas. Essa matemática é calculada na saída. PDFs gerados a partir do Indesign exportam a matemática não imagens rasterizadas .
Provavelmente, é o "serviço" que tem o problema, e não elementos vetoriais em seus PDFs, a menos que você esteja definindo especificamente o InDesign para rasterizar tudo na exportação para PDF.