Por exemplo, o comando a seguir transformará todos os pixels brancos em uma janela do Win Explorer em 50% transparente:
WinSet, TransColor, FFFFFF 128, ahk_class ExploreWClass
No entanto, na prática, você pode achar essa abordagem uma dor real, já que os cliques em um pixel transparente "caem" e afetam a janela abaixo. Além disso, não é possível (AFAIK) com o AHK restringir a transparência a uma região específica quando você usa TransColor . Isso significa que, se você usar FFFFFF, todos os pixels em branco todos da janela serão afetados, e não apenas os do fundo da janela.
Uma solução adequada de transparência tem que vir dos desenvolvedores do aplicativo; geralmente não pode ser aparafusada assim e espera-se que funcione perfeitamente.