O Macvim normalmente é aberto a partir da linha de comando com
mvim
Se você pegar o script mvim que veio com o MacVim e colocar em ~/bin (ou criar um link simbólico se preferir)
Em seguida, no seu ~/.bashrc , adicione a seguinte linha.
export PATH="~/bin:$PATH"
Em seguida, execute
source ~/.bashrc
Isso colocará mvim em seu PATH para que você possa executá-lo.
Se você quiser alias do vim para abrir o macvim, você pode adicionar o seguinte ao seu ~/.bashrc (se mvim não estiver no seu caminho)
alias vim=<full path to mvim>
Se mvim estiver em seu PATH, você deve ser capaz de colocar
alias vim=mvim