Quando você copia um arquivo grande, o sistema pode gastar um tempo enorme para executá-lo, por isso está sendo executado em segundo plano.
Certifique-se de que a cópia do arquivo esteja completa usando # lsof /media/usb/bigfile
Você pode solicitar uma sincronização de cópia de arquivo com # sync
E você pode desmontar seu dispositivo da maneira preguiçosa: # umount -l /media/usb
Do umount (8):
-l Lazy unmount. Detach the filesystem from the filesystem hierarchy now, and cleanup all references to the filesystem as soon as it is not busy anymore. (Requires kernel 2.4.11 or later.)