Por exemplo, se você quiser que a tecla de menu funcione como 'o', primeiro crie um arquivo xmodmap:
$ xmodmap -pke > ~/.Xmodmap
Abra o arquivo e procure a linha que contém o mapeamento da tecla de menu, algo como:
keycode 135 = Menu Insert Menu
Você também pode iniciar o xev, digitar a tecla de menu e procurar o código na saída do xev. Em seguida, substitua tudo após o sinal de igual pelo mapeamento desejado, ou seja, se você quiser que ele se comporte como 'o', use algo como:
keycode 135 = o O o O
Para usar o novo arquivo xmodmap, digite
$ xmodmap ~/.Xmodmap
As configurações geralmente são perdidas após o desligamento, no entanto, eu não tenho certeza se o Ubuntu de alguma forma carrega o .Xmodmap automaticamente.