Após uma verificação de mais de 200 horas de mais de 200GB de informações de backup no meu disco rígido externo, o MSE encontrou um único vírus Win32 / cmdow.A dentro de um instalador rar de uma expansão de código aberto de um jogo .. e agora ficou preso na marca de 75% durante a remoção de infecções.
Use o Monitor de Recursos para ver se o processo do MSE está lendo o arquivo ou consumindo memória. Se não for, eu diria que o MSE travou e mate o processo, reinicie e tente a verificação novamente.
Eu também procuraria online se você pode confirmar se o pacote de código aberto tem vírus.