O WOL está usando o nível 2 (ethernet) do OSI para enviar os pacotes de ativação "mágicos". O IP (nível 3 do OSI) não é usado. Para ativar um PC em sua LAN pela Internet, você precisaria de um roteador que permitisse fazer login a partir da interface externa e enviar o pacote para a LAN local. Muitos roteadores populares têm esse recurso.
Estas são as instruções sobre como implementar o WOL remoto usando DD-WRT - apenas para dar-lhe a noção do que está envolvido.