A estrutura interna do MDB / MDE e do ACCDB / ACCDE é completamente diferente.
Quando você altera a extensão do arquivo de MDE para ACCDE, a estrutura interna permanece MDE como antes. Não importa o Access porque o Access sabe como abrir o arquivo. No entanto, versões futuras do Access podem falhar ao abri-lo.
Você não explicou Por que você quer mudar o MDE para ACCDE? Se o nome mudar, ele atende às suas necessidades, tudo bem. Mas se você quiser que a estrutura do arquivo seja atualizada, esta não é a solução.