Não vejo nenhum problema em fazer isso. Esses são apenas comandos simples do DOS para fazer o backup dos arquivos de registro corrompidos e depois sobrescrever com boas cópias da pasta windows \ repair. O gerenciador de inicialização do XP não deve ser afetado, a menos que você execute o fixboot, o fixmbr e outros semelhantes do Recovery Environment do Win7. Se você quiser usar uma GUI, você também pode fazer isso usando um LiveCD / USB do Linux.