Como o cara diz no link que eu forneci abaixo:
A instalação completa do Windows 8 para pen drive USB consumiria cerca de 12 GB de espaço, além de seus próprios aplicativos de software. Além disso, seria necessário armazenamento temporário e de troca. Você pode viver com o pen drive de 16gb, mas logo você será sufocado.
Restante das instruções pode ser lido aqui, dado que você tem um pen drive de tamanho suficiente