Meu instinto seria recomendar o uso do IMAP, é melhor sincronizar o cliente com o servidor, mas se isso não estiver disponível, por que não tentar:
- Mover todas as mensagens da caixa de entrada do arquivo PST original para uma nova pasta Original_Inbox
- Configure o novo perfil do Outlook com o arquivo PST original
- Permitir que baixe o email POP na pasta Caixa de Entrada
- Excluir qualquer e-mail duplicado da Caixa de entrada
- Mova o email Original_Inbox de volta para a pasta Caixa de entrada.
É o melhor que consigo pensar sem o IMAP.