Resposta curta: Se você escrever o software você mesmo, então sim. Usando o software existente, não.
A pesquisa por "placa PCIe de desligamento" mostra que você não é o único que procura esse recurso. Alguns dos resultados, por exemplo " Desligue o vidcard PCI-e discreto "(que erro de digitação!) diga que é impossível, mas não faça isso. Outros, como Alguém sabe como desligar um slot PCIe? (por exemplo, placa de vídeo) abordar isso com mais seriedade, mas não conseguiu.
Existe até uma pergunta sobre isso aqui, É possível desligar uma placa de vídeo / slot PCIe? (por exemplo, hot-plug) , sem uma solução, embora (você deveria ter mencionado isso!; -).
Você indica HD6700 em um lugar e HD6500 no outro. Qual deles é isso? Os nomes dos modelos reais têm pelo menos mais um dígito significativo. 6570, 6750, 6770 e 6790, todos têm diferentes potências de marcha lenta. De acordo com o link , o consumo de energia está entre 10 e 19 Watt.
19 Watt não é muito, mas aparentemente ainda precisa de resfriamento ativo. Você disse que quer o ventilador desligado, então seu problema subjacente é aparentemente seu ruído. Você pode ser capaz de diminuir a velocidade do ventilador usando ferramentas de software específicas da ATI (eu tenho NV, então não sei quais funcionariam para você).
Meu palpite é que os sistemas operacionais de desktop hoje em dia não se importam o suficiente com essa quantidade de energia desperdiçada, e simplesmente não suportam desligar a energia de uma placa PCIe. (Mas eles deveriam, na minha opinião.)Se você estiver realmente interessado, poderá ver o que os sistemas operacionais de dispositivos móveis, como o Linux (incluindo o Android), estão fazendo. Eles dinamicamente ligam dispositivos para economizar energia. Na lista de discussão dos proprietários do GTA04, pelo menos, há várias discussões sobre como ligar e desligar dispositivos como o wifi, bluetooth e outros. Eles pelo menos sabem como as interfaces de controle de energia se parecem no Linux. Isso pode ajudá-lo a descobrir se isso já foi implementado para dispositivos PCIe.
Dependendo da frequência com que você precisa da potência 3D do cartão discreto, sua melhor opção pode ser remover o cartão (como você disse). Ou coloque-o em um PC separado, que você inicializa apenas quando necessário.