Tente diminuir um pouco o volume do vídeo do YouTube dentro do player do YouTube (é estranho, eu sei, mas funcionou para mim).
Eu estava tendo o mesmo problema - O som funcionou bem em alguns vídeos do youtube, mas não em outros - o som em alguns vídeos era inexistente ou eu ouvia apenas sons de pop e estalos.
Atualizei o Flash, desativei meu antigo plug-in flash no Firefox (ferramentas- > complementos- > plugins) e reiniciei o Firefox sem sucesso.
Depois, abaixei o volume dentro do player do YouTube e pude ouvir o som corretamente. Eu acho que em alguns desses vídeos, eles tentam alterar a trilha sonora para torná-los mais barulhentos e isso causa uma falha onde o som não toca ... Esse é o meu melhor palpite a respeito do porque isso funcionou para mim.
Boa sorte!