A razão pela qual a maioria dos tutoriais começa com o Windows e depois instala o Ubuntu é que o Windows instala seu próprio gerenciador de inicialização que não reconhece o Ubuntu como um sistema operacional válido. Felizmente, é bastante fácil restaurar o bootloader do Ubuntu, que reconhece o Windows.
Como eu faria isso:
- (antes de instalar o Windows) reparticione o disco no Ubuntu (o Windows precisa de pelo menos 20 GB)
- instalar o Windows
- inicialize no LiveCD do Ubuntu
- instale e execute Reparo de inicialização
Veja este artigo da Documentação do Ubuntu para mais informações.