Parece que algo está fazendo uso excessivo da unidade de disco rígido e talvez também o CPU, atolamento assim o sistema para baixo.
Use Monitorar para ver o processo (s) estão acessando o sistema de arquivos (somente seleccionar o filtro de arquivo) e Process Explorer para descobrir o que processo (s) estão usando a CPU (certifique-se para permitir que o gráfico da CPU torne mais fácil identificar o culpado: right-click the column header->Select Columns->Processes->History
).