Faça backup do seu sistema usando o Time Machine.
Em seguida, você pode apagar todo o disco, instalar o Lion de forma limpa e restaurar apenas, por exemplo. contas de usuário, mas não aplicativos.
O título praticamente diz tudo. Fico feliz em copiar pastas ou usar um utilitário. Eu sei que muitas preferências são mantidas em ~ / user / Library / Application Support.