Contanto que você esteja usando o XP (ou mais recente) como seu sistema operacional, não há necessidade de tocar / alterar a CPUID e desativá-la novamente.
Tudo isso dito, eu duvido que você vai ver muito ganho de velocidade com o novo processador - certamente nada importante e você seria melhor de poupar o dinheiro ou comprar uma máquina Core 2 de segunda mão.No entanto, como você o comprou e está em um orçamento, eu adivinho (como você não especificou) que você não usou nenhum novo composto térmico. Eu estou fazendo esse palpite, já vi esses sintomas algumas vezes. O ventilador geralmente entra em ação a uma velocidade média e no momento em que os sensores térmicos entram em ação, ele aumenta a velocidade.
As máquinas Pentium 4 eram notórias por seu calor e se o seu fã durou tanto tempo, bem feito! Eu tive alguns clientes com CPUs baseadas em Prescott mais recentes que desistiram há cerca de 2 anos - então, você fez bem, mas talvez seja hora de atualizar o ventilador.