Se esse comportamento for causado por um vírus, é altamente provável que seus arquivos de programas que foram deixados na partição estejam infectados.
Sua melhor opção é obter um disco de recuperação que você possa inicializar e executar um disco completo digitalização de tudo. Se o vírus puder ser removido, caso contrário, você terá a opção de excluir arquivos infectados.