Ele desativará completamente o Secure Boot porque, como diz, esses programas de terceiros não funcionarão com ele. Ele está pedindo uma senha, porque, como diz, só vai ter certeza de que você está desativando quando o Ubuntu mostrar como fazer isso. É uma senha temporária.
Você não pode facilmente ativar a Inicialização Segura e também carregar módulos do kernel que não estejam assinados para funcionar. Não há muito benefício para o Secure Boot, e muitos (provavelmente a maioria) usuários do Ubuntu / Linux se sentem confortáveis em desativá-lo permanentemente.