De acordo com essa listagem de diretórios, bin não é um diretório, mas um arquivo regular (é o que o primeiro -
in -rwxr-xr-x@
indica). É um alias ou algo parecido? Além disso, o @
nessa listagem indica que ele estendeu atributos e talvez também uma ACL (que pode substituir permissões regulares) - tente ls -leO@ ~/bin
para obter informações mais completas sobre ele.