Você pode criar atalhos na área de trabalho para o Chrome com o sinalizador -app (ou como é) e a URL como os parâmetros. Ele abre nova janela do Chrome, sem as barras de ferramentas e guias. Simplesmente velha janela com min, max, fechar. Então você pode mover essa janela para outras áreas de trabalho ... etc. Ela não se comportará como um aplicativo clássico ...
Além disso, a maneira mais simples é fixar sua guia no chrome (clique com o botão direito na guia, marque a guia Pin). Isso tornará a guia menor (somente o ícone ficará) e não poderá ser fechado até que seja liberado novamente.
EDIT: desculpe se isso é muito chrome-ish resposta:)