Sim, é. É chamado de bootloader.
Quando você instala o segundo Windows, ele adiciona automaticamente a entrada ao gerenciador de inicialização e, em seguida, mostra o menu para a seleção do sistema operacional quando você inicializa o computador. Isso pressupõe que o segundo Windows seja o mais novo (por exemplo, o Windows XP já está instalado e você está instalando o Windows 7).
Se você já tem o Windows 7 e instalará o Windows XP (ou caso semelhante), o CD de instalação mais recente com a opção de recuperação provavelmente corrigirá o problema.
Configurar o gerenciador de inicialização é um processo mais complexo se você misturar sistemas operacionais diferentes, por exemplo, Linux e Windows.