Eu suspeito que você tenha sido seletivo demais com suas pastas.
O regedit está no Windows, eu acho, e não no System32, então acho que é por isso que não está funcionando. services.msc deve estar em% SYSTEMROOT% \ System32, portanto, não tenho certeza de por que isso não está funcionando. Como teste, você poderia indexar a unidade inteira (ou pelo menos de% WINDIR% para baixo.