O arquivo da área de trabalho especifica Icon=/path/name.xpm
Mas o ícone atual é 
Este é o ícone antes de eu especificar o ícone no arquivo da área de trabalho. Por algum motivo, o ícone nunca é atualizado, mesmo durante as reinicializações.
Posso confirmar que este é o arquivo correto da área de trabalho (se eu remover o arquivo, o aplicativo desaparece).
Qual ícone é esse? Como posso informar o cache de ícones?
SO usado: Ubuntu 16.04
Acho que encontrei a resposta.
desktop-file-install provavelmente adicionou automaticamente um ícone padrão Icon[en_US]=gnome-panel-launcher antes de adicionar o ícone abaixo dele. Eu não vi totalmente essa linha.
O mais provável é que o ícone específico da localidade tenha precedência sobre o ícone