Você não precisa desativar um computador se estiver transferindo sua licença de um computador para outro. Se uma cópia do Windows é licenciada é um conceito legal; é separado da "ativação", que é uma questão técnica.
Se você tem uma cópia comercial do sistema operacional que permite a transferência de licenças entre computadores, basta instalar o Windows no novo computador. Contanto que você não use mais a instalação anterior, não estará violando o contrato de licença. Se a nova cópia do Windows não for ativada (alegando que sua licença já foi usada em outra máquina), você poderá entrar em contato com a Microsoft e eles permitirão a ativação.
Se você tiver uma cópia OEM do Windows, as probabilidades são boas de que a licença esteja vinculada a essa máquina específica; a licença não pode ser transferida entre computadores. Você pode reinstalar o Windows na mesma máquina, mas não pode usar um conjunto diferente de hardware.