Não há uma maneira genérica de reverter user-config para um pacote. Cada pacote pode armazenar sua própria configuração de usuário no diretório inicial do usuário. Normalmente, onde estes são armazenados são descritos nas páginas de manual de um pacote, mas nem sempre.
Você precisa encontrar e remover esses arquivos manualmente. A maioria das configurações para aplicativos GTK é encontrada em ~/.config
directory
Você pode querer ler essa pergunta útil no Unix & amp; Linux SE sobre a pasta de arquivos de configuração.
(Obrigado ao edwinksl pelo link)