Feche o Thunderbird e renomeie-o para algo diferente de 'Inbox' (como 'RecoveredMail'). Dependendo da sua configuração (por exemplo, IMAP), o Thunderbird não estará procurando pela pasta Caixa de Entrada nas Pastas Locais, mas somente pastas não especiais (nomeie qualquer coisa, exceto Caixa de Entrada, Rascunhos ou Enviados). Você também pode excluir com segurança o arquivo msf, é apenas um índice e o Thunderbird irá reconstruí-lo.