Você nunca pode ter certeza. Mas vai ajudar. Eu uso ClamXav no OS X. Outra coisa que você pode fazer é navegar pelo conteúdo da unidade usando o Terminal. Dessa forma, você será capaz de capturar rapidamente arquivos que podem parecer fora do lugar. Eu sempre faço isso quando tenho que conectar um USB que tenha sido usado em um sistema Windows: eu o conecto no meu laptop rodando Linux ou no meu MacBook, e dou uma olhada no conteúdo através do shell.