Meu palpite é que você é um usuário do Windows ou do Mac e acabou de começar a usar o ssh para se conectar a um servidor Linux.
Se esse palpite estiver correto ...
Primeiro, perceba que o ssh é apenas a ferramenta que permite que você tenha uma sessão de linha de comando remota neste outro servidor. Uma vez que você esteja conectado, o ssh é transparente e irrelevante para o que você está fazendo lá.
Em seguida, agora que o ssh está fora de cena, você está realmente perguntando sobre o que você faz com arquivos e diretórios em um servidor Linux. As especificidades disso irão variar dependendo da versão do Linux que você está usando e do shell que você está usando (o shell é o programa usado para aceitar e processar os comandos que você digita).
Você pode encontrar a versão do Linux digitando lsb_release -a . A saída provavelmente incluirá "Fedora", "Red Hat", "Debian" ou "Ubuntu". Google para tutoriais sobre essa versão linux.
Você pode descobrir qual shell está usando digitando echo $SHELL . A saída provavelmente dirá "/ bin / bash" ou algo mais com 'bash' nela. Google para tutoriais bash.
Por fim, a localização de arquivos e diretórios também pode depender do que eles usam. Se você estiver trabalhando com arquivos para serem atendidos pelo servidor web Apache, eles precisarão ser colocados em um local que seja definido pelo seu servidor web Apache. Mais uma vez, google para tutoriais específicos para o software que você está usando.