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O Prompt de Comando é uma continuação do antigo MS-DOS, em que a única maneira de se comunicar com dispositivos especiais era usar os nomes dos dispositivos: PRN, CON, Etc ...
Isso basicamente significa que um arquivo chamado por um dispositivo, seguido por um ponto, é ilegal no Windows. O MS-DOS tem uma solução alternativa para isso, mas o Powershell não tem. Isso basicamente significa que você não pode trabalhar com um arquivo que violou esse nome de arquivo ilegal no Windows.
Então, sim, eles são muito diferentes por esse motivo. Não apenas no que eles podem fazer, mas toda a sintaxe é diferente. O Powershell pode ser usado para fazer coisas que o Prompt de Comando pode, mas não o contrário.