Embora seja possível debater a definição exata do padrão PEM, a definição formal mais próxima é a RFC 7468 . Você não encontrará -----BEGIN ENCRYPTED CERTIFICATE-----
lá. Além disso, por que criptografar um certificado quando é um documento público?
Portanto, a resposta para sua pergunta é - "não".
No entanto, com certificados não criptografados, é um "sim". O seguinte é aceitável:
-----BEGIN CERTIFICATE-----
-----END CERTIFICATE-----
-----BEGIN ENCRYPTED PRIVATE KEY-----
-----END ENCRYPTED PRIVATE KEY-----