Para o WPA-Enterprise moderno, você precisa definir key_mgmt to WPA-EAP . (Você deve ter notado que a maioria dos valores no NM são praticamente idênticos ao que o wpa_supplicant aceita diretamente.)
Existem duas maneiras diferentes de usar o 802.1X para Wi-Fi e escolher IEEE8021X na verdade seleciona o modo "WEP dynamic keying" (ou possivelmente até mesmo um modo de texto simples, somente autenticação).
Eu sugeriria ficar com o NetworkManager e apenas remover a opção permissions= , para que a conexão se tornasse em todo o sistema.