Parece que você pode rodar nvidia-settings na linha de comando, assim:
nvidia-settings --config=~/.nvidia-settings --load-config-only
Tente fazer isso funcionar na linha de comando. Quando estiver pronto, você pode simplesmente adicionar isso para executar na inicialização. Verifique as respostas juanjux e eu dei a esta pergunta sobre como adicionar um script para ser executado na inicialização .
Note que isso permitirá que o script seja executado na inicialização, e não apenas quando o ambiente gráfico do GDM / KDE for iniciado.