O USB 3.0 pode suportar mais energia do que o USB 2.0 : 500mA por porta USB 2.0 máxima, vs. 900mA por porta USB 3.0. Ao girar, o HDD consome mais corrente do que quando está em execução, portanto, parece que as portas USB 2.0 (e talvez uma porta USB 3.0) estão um pouco sem energia para esta unidade. Como afirma @dirkt, o disco rígido externo provavelmente funcionaria de um hub com energia.
No entanto, outra possibilidade é que o Registro chave USBSTOR armazena informações sobre o disco rígido que está causando o problema. É possível remover essas entradas usando Regedit
ou, mais convenientemente, usando a ferramenta gratuita USBDeview
de Nirsoft