Você pode fazer isso usando um arquivo em lotes ou um script de shell de energia. Um arquivo de lote simples pode ser criado assim:
@ECHO OFF
:START
for %%F in (*0.jpg *2.jpg *4.jpg *6.jpg *8.jpg) do move "%%F" "Folder1\"
for %%F in (*1.jpg *3.jpg *5.jpg *7.jpg *9.jpg) do move "%%F" "Folder2\"
Timeout /T 30
GOTO START
Esse arquivo continuará procurando por arquivos a cada 30 segundos e moverá arquivos para pastas diferentes quando o arquivo for encontrado.
O único ponto negativo é que ele continuará correndo em uma aparência infinita. Você precisa pará-lo usando Ctrl + C
quando terminar.
Atualização:
Para a inicialização automática, você pode criar um atalho na pasta Iniciar do menu Iniciar com o caminho para o arquivo em lotes e especificar a pasta de trabalho como caminho para a pasta de imagens. Manter a propriedade Executar do atalho como Minimizado. Ele será executado e minimizado na barra de tarefas.