Assumindo um instalador genérico, não-scriptable ou inteligente, você não pode. Se um instalador for codificado para procurar um arquivo em um caminho relativo, esse arquivo completo deverá estar onde espera, ou falhará. Além disso, você não pode simplesmente dividir um arquivo e esperar que o instalador entenda que o arquivo foi modificado ou que deve procurar por outro arquivo. Poderia muito bem ser o arquivo .bin é comprimido e você não seria capaz de descompactá-lo sem o arquivo estar completo.
Você pode criar um arquivo auto-descompressivo e dividi-lo entre quantos discos desejar. Você pode copiar o conteúdo para o computador e executá-lo ou executá-lo a partir do disco. Em seguida, execute o instalador e exclua os arquivos quando terminar.