Esse problema pode ser confundido com um problema de dead-on-arrival, mas, neste caso, não foi. Foi um bug do Windows 8/10.
Explicação
Disk Management / DiskPart tem um bug no Windows 8 e no Windows 10, onde certos formatos de unidade (exatamente quais formatos eu não me incomodei em descobrir) impedirão que toda a unidade seja exibida e conseqüentemente seja reformatada.
Solução
Use uma ferramenta de formatação de terceiros ou formate a unidade a partir de uma instância do Windows 7 (possivelmente até uma VM). O bug não está presente no Windows 7 e você poderá ver e formatar a unidade.
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