Pelo que sei, isso não é possível. Eu vi que tudo o que você pode fazer é desinstalar e, em seguida, reinstalar com as opções corretas para o msi para evitar a atualização automática.
Parece ser uma configuração por usuário, portanto, corrigi-lo para um usuário parece funcionar, mas apenas até que alguém faça login na estação.
Veja aqui uma dessas discussões link