Não, isso não é possível porque um aplicativo está instalado para todos.
Em alguns casos, um aplicativo é instalado apenas para um único usuário, mas somente esse usuário tem acesso a ele em primeiro lugar.
Dito isso, você pode desativar o acesso e impedir que um determinado usuário use um programa. Você pode fazer isso por meio da Diretiva de Grupo, definindo permissões de pasta e alguns outros métodos funcionam.