Não sei explicar porque funcionou pela primeira vez, mas não no segundo. Se você está recebendo uma tela como abaixo, há dois motivos possíveis.
Vocênãotemodriverparaoseucontrolador
ComovocêjátemoWindows7emexecução,inicie-oeuseo
Quando você reinstalar o Windows e ele não puder ver o disco rígido, clique na opção que permite carregar um driver e apontá-lo na pasta correta do pendrive. Ele localizará o driver correto, instalará e, em seguida, você poderá prosseguir.
A vantagem de fazer isso apenas com o download do driver único é que os drivers que ainda estão faltando após a instalação podem ser reinstalados apenas apontando o Gerenciador de Dispositivos para a pasta no dispositivo USB.
A última coisa que você quer é reinstalar o Windows e, em seguida, descobrir que está faltando um driver para algo essencial - como WiFi ou Ethernet.
Seu tipo de instalação não está correto
Como Ramhound fez alusão, você pode estar misturando o UEFI e Legacy Mode com MBR e GPT. Se este for o caso, então você não poderá instalar nada no disco rígido e esta resposta deve ajudá-lo.
(como uma nota secundária, se você não tiver acesso às suas chaves de licença do Windows e do Office, talvez queira usar Advanced Tokens Manager para fazer o backup e restaurá-los. Isso não funcionará para o Windows 10)