Você terá duas opções para escolher quando estiver passando pela instalação
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Você pode criptografar toda a unidade e, na inicialização, exigirá uma senha em cada inicialização para funcionar e, em seguida, iniciará a inicialização normalmente. esta é a maneira mais segura de bloquear o seu PC
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você pode simplesmente criptografar sua pasta Home, onde você armazena documentos, imagens e outros arquivos. Quando você faz o login, sua pasta pessoal é descriptografada e você pode usá-la normalmente.
Eu usei ambos e não vi muito de uma diminuição de desempenho do éter. Agora, algo a ter em mente é como recuperar suas informações no caso de sua placa-mãe morrer e precisar obter as informações da unidade.
Eu sei que para a criptografia de pasta de usuário o Ubuntu o ajudará a configurá-lo assim que o sistema for instalado e lhe dará uma chave de recuperação para usar neste caso, mas não tenho certeza sobre a criptografia completa do disco rígido que pode não ter a habilidade.