Para quem pode ter o mesmo problema.
Como @lungj apontou nos comentários, parece que o problema foi devido a variáveis de ambiente que foram configuradas incorretamente.
Desmarcar o seguinte resolveu o problema:
unset LD_LIBRARY_PATH
unset LDFLAGS
unset CFLAGS
Eu não tive que instalar / alterar qualquer outra coisa.