Você precisa usar o GTK3 para carregar um arquivo criado com o Glade 3.x. Como o Glade 2.x não está disponível no Ubuntu, a mudança para o GTK3 é a sua melhor opção.
Para usar o GTK3 no Python, você precisa mudar do PyGTK para PyGObject . Veja o Tutorial do Python GTK + 3 para saber como usá-lo.