Bem-vindo ao superusuário
Se você está tão inseguro, sugiro anexar fisicamente apenas uma unidade (a futura do Linux) na hora da instalação. Você também pode preparar espaço livre não particionado nessa unidade com o Windows, se isso faz você se sentir melhor: -)
Em seguida, instale o Linux: todas as distribuições gráficas modernas perguntarão se você deseja usar espaço "livre" (não particionado) e elas podem fazer isso por você.
Ele funcionará se você usar um único ponto de montagem como / ou o estilo "many partition" clássico do Linux. Não esqueça de adicionar algum espaço de troca. Bônus, você poderia jogar com o grub no disco rígido até que o Windows seja reconhecido também. Deve ser fácil.